影响厌氧池的因素主要有：
1.温度
按三种不同嗜温厌氧菌（嗜温5-20℃ 嗜温20-42℃ 嗜温42-75℃）工程上分为低温厌氧(15-20℃)、中温厌氧（30-40℃）、高温厌氧（50-60℃）三种。温度对厌氧反应尤为重要，当温度低于最优下限温度时，每下降1℃，效率下降11%。在上述范围，温度在1-3℃的微小波动，对厌氧反应影响不明显，但温度变化过大（急速变化），则会使污泥活力下降，度产生酸积累等问题。
2.pH值
厌氧水解酸化工艺，对pH要求范围较松，即产酸菌的PH应控制4-7℃范围内；完全厌氧反应则应严格控制pH，即产甲烷反应控制范围6.5-8.0，最佳范围为6.8-7.2，pH低于6.3或高于7.8，甲烷化速率降低。
氧化还原电位：水解阶段氧化还原电位为-100～+100mv，产甲烷阶段的最优氧化还原电位为-150～-400mv。因此，应控制进水带入的氧的含量，不能因以对厌氧反应器造成不利影响。
3.营养物
氧反应池营养物比例为C:N:P=(350-500):5:1。
4.有毒有害物
抑制和影响厌氧反应的有害物有三种。
（1）无机物：有氨、无机硫化物、盐类、重金属等，特别硫酸盐和硫化物抑制作用最为严重；
（2）有机化合物：非极性有机化合物，含挥发性脂肪酸(VFA)、非极性酚化合物、单宁类化合物、芬香族氨基酸、焦糖化合物等五类。
（3）生物异型化合物：含氯化烃、甲醛、氰化物、洗涤剂、抗菌素等。
